Articles in peer-reviewed journal
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Fan, X.-R., Wang, X., Kang, M., Hua, J., Guo, S., de Reffye, P., Hu, B. G., 2018. A knowledge-and-data-driven modeling approach for simulating plant growth and the dynamics of CO2/O2 concentrations in a closed system of plants and humans by integrating mechanistic and empirical models. Computers and Electronics in Agriculture, 148 : 280-290
Kang, M. Z., Hua, J., Wang, X. J., de Reffye, P., Jaeger, M., Akaffou, S., 2018. Estimating Sink Parameters of Stochastic Functional-Structural Plant Models using Organic Series-Continuous and Rhythmic Development. Frontiers in Plant Science, 9 (1688) : 1-17
Guo, J.-W., Xu, S.-B., Yan, D.-M., Cheng, Z.-G., Jaeger, M., X. Zhang, X.-P., 2018. Realistic Procedural Plant Modeling from Multiple View Images. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics. Doi: 10.1109/TVCG.2018.2869784
Okoma, M. P., Akaffou, S., de Reffye, P., Hamon, P., Hamon, S., Konan, O., Kouassi, K. H., Legnate, H., Letort, V., Sabatier, S.-A., 2018. Estimation of stem and leaf dry biomass using a non-destructive method applied to African Coffea species. Agroforestry Systems, 92 (3) : 667-675.
Tondjo, K. , Brancheriau, L., Sabatier, S.-A., Kokutse, A. D., Kokou, K., Jaeger, M., de Reffye, P., Fourcaud, T., 2018. Stochastic modelling of tree architecture and biomass allocation: application to teak (Tectona grandis L. f.), a tree species with polycyclic growth and leaf neoformation. Annals of Botany, 121 (5) : 1397-1410.
Peer-reviewed conferences
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de Reffye, P., Jaeger, M., Sabatier, S., and Letort, V. (2018). Modelling the interaction between functioning and organogenesis in a stochastic plant growth model: Methodology for parameter estimation and illustration. In 2018 6th International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (PMA) (pp. 102-110). IEEE
Jaeger, M., Sabatier, S., Borianne, P., de Reffye, P., Gang, Y., Letort, V., Zhang, X.-P., and Kang, M.-Z. (2018). Data visualization for vegetal landscapes: Building 3D representations of organ biomass compartments: How plant production could constrain 3D lollypop-like representations. In 2018 6th International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (PMA) (pp. 85-93). IEEE
Ribeyre, F., Jaeger, M., Ribeyre, A., and de Reffye, P. (2018). StemGL, a FSPM tool dedicated to crop plants model calibration in the single stem case. In 2018 6th International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (PMA) (pp. 33-38). IEEE
Books and book chapters
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de Reffye, P., Jaeger, M., Barthélémy, D., Houllier, F., 2018. Architecture des plantes et production végétale. Les apports de la modélisation mathématique. Versailles: Quae : 357 p.
Sabatier, S.-A., Barthélémy, D., de Reffye, P., 2018. Notions de botaniques sur l'organisation des structures végétales.
In Barthélémy, D., de Reffye, P., Houllier, F., Jaeger, M. (Eds) Architecture des plantes et production végétale. Les apports de la modélisation mathématique. Versailles : Quae, 19-40 p. (Synth&eagrave;ses).
Hu, B. G., Barthélémy, D., de Reffye, P., 2018. Structures et architectures végétales : modélisation et simulation.
In Barthélémy, D., de Reffye, P., Houllier, F., Jaeger, M. (Eds) Architecture des plantes et production végétale. Les apports de la modélisation mathématique. Versailles : Quae, 41-88 p. (Synth&eagrave;ses).
de Reffye, P., Heuvelink, E., Letort, V., Kang, M.-Z., 2018. Modélisation de la croissance végétale : cas déterministe.
In Barthélémy, D., de Reffye, P., Houllier, F., Jaeger, M. (Eds) Architecture des plantes et production végétale. Les apports de la modélisation mathématique. Versailles : Quae, 89-127 p. (Synth&eagrave;ses).
de Reffye, P., Kang, M.-Z., 2018. Modélisation de la croissance végétale, les opérateurs de croissance : cas stochastique.
In Barthélémy, D., de Reffye, P., Houllier, F., Jaeger, M. (Eds) Architecture des plantes et production végétale. Les apports de la modélisation mathématique. Versailles : Quae, 129-158 p. (Synth&eagrave;ses).
Kang, M.-Z., de Reffye, P., 2018. Modélisation de l'acropétalie et de la basipétalie chez les herbacées.
In Barthélémy, D., de Reffye, P., Houllier, F., Jaeger, M. (Eds) Architecture des plantes et production végétale. Les apports de la modélisation mathématique. Versailles : Quae, 159-179 p. (Synth&eagrave;ses).
Letort, V., Houllier, F., de Reffye, P., Blaise, F., 2018. La croissance secondaire.
In Barthélémy, D., de Reffye, P., Houllier, F., Jaeger, M. (Eds) Architecture des plantes et production végétale. Les apports de la modélisation mathématique. Versailles : Quae, 181-201 p. (Synth&eagrave;ses).
Zhang, B. G., Guo, Y., Heuvelink, E., Rey, H., de Reffye, P., 2018. Validation du mod&eagrave;le GreenLab sur les plantes cultivées.
In Barthélémy, D., de Reffye, P., Houllier, F., Jaeger, M. (Eds) Architecture des plantes et production végétale. Les apports de la modélisation mathématique. Versailles : Quae, 203-250 p. (Synth&eagrave;ses).
Courn&eagrave;de, P.-H., de Reffye, A., 2018. Le passage de la plante au peuplement.
In Barthélémy, D., de Reffye, P., Houllier, F., Jaeger, M. (Eds) Architecture des plantes et production végétale. Les apports de la modélisation mathématique. Versailles : Quae, 251-292 p. (Synth&eagrave;ses).
de Reffye, P., Jaeger, M., Mathieu, A., 2018. Applications de la modélisation de l'architecture des plantes.
In Barthélémy, D., de Reffye, P., Houllier, F., Jaeger, M. (Eds) Architecture des plantes et production végétale. Les apports de la modélisation mathématique. Versailles : Quae, 293-328 p. (Synth&eagrave;ses).
PhD thesis
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Oral Communications
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de Reffye, P., 2018. Architecture et production végétale. Conférence invitée à la Société d'Histoire Naturelle de l'Hérault. Montpellier 12 Décembre 2018
Jaeger, M., 2018. GLUVED e-learning resources presentation. Invited talk at China Agricultural University, Department of Environmental and Soil Sciences (CAU), 2018, November 11th, Beijing, China
Jaeger, M., 2018. StemGL presentation: a FSPM tool dedicated to crop plants model calibration in the single stem case. Invited talk at China Agricultural University, Department of Environmental and Soil Sciences (CAU), 2018, November 11th, Beijing, China
de Reffye, P., 2018. Crop Production Driven by Plant Architecture. Inivited talk at 6th International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications - PMA2018, 04-08 November 2018, Hefei, Anhui, China
de Reffye, P., 2018. Architecture et production végétale. Conférence invitée au Rotary Club. Montpellier Février 2018.
Jaeger, M., 2018. Some recent works and projects at CIRAD-AMAP unit concerning imaging applications related to the vegetation (flora, Agronomy, Ecology). Invited talk at Institute of Automation of Chinese Academy of Sciences (CASIA), 2018, November 9th, Beijing, China
Jaeger, M., 2018. Deep Learning imaging applications related to the vegetation (flora, Agronomy, Ecology) at AMAP Unit. Talk at China Agricultural University, Department of Environmental and Soil Sciences (CAU), 2018, November 11th, Beijing, China
Reports
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Jaeger, M., 2018. E-LEARNING ET MODELISATION DES PLANTES. Rapport pour la Direction d'unité. Etude 2016-2018. Septembre 2018. 62 p.
Jaeger, M., 2018. Rapport final Projet TALVEG 2. Partie synthèse (pour la société Valorhiz). Août 2018. 24 p.
Others
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Viennois, G., Borne, F., Jaeger, M., Borianne, P., 2018. Poster. Quelle vérité terrain pour les réseaux de neurones en imagerie drone ? Application à la détection de palmier Raphia en forêts au Gabon.
Conférence Française de Photogrammétrie et de Télédétection (CFPT) 2018, 25-28/06/2018, Marne-la Vallée, France.
Jaeger, M., 2018. Poster. GLUVED: An E-learning resources set. http://greenlab.cirad.fr/GLUVED Poster/demo presentation at PMA18 04-08 November, 2018, Hefei, Anhui, China.
de Reffye, P., Jaeger, M., 2018. Poster. CropGL: A crop model FSPM parameter estimator. http://greenlab.cirad.fr/StemGL Poster/demo presentation at PMA18 04-08 November, 2018, Hefei, Anhui, China.
Jaeger, M., de Reffye, P., 2018. Modélisation et simulation de la croissance des plantes : un système dynamique et complexe. Les Dossiers d'Agropolis International. Systèmes complexes de la biologie aux territoires. 23, June 2018. p.31